De acuerdo con el Real Decreto 1629/2006, las enseñanzas de la Escuelas Oficiales de Idiomas se estructuran en 3 niveles, formado cada uno por 2 cursos: Nivel Básico (A2), Nivel Intermedio (B1) y Nivel Avanzado (B2).Los niveles indicados entre paréntesis se refieren a los niveles establecidos en el Marco Común Europeo de Referencia para las Lenguas (MCER).
Este curso 2007-08, se han implantado los 2 primeros niveles, simultaneándose con el Ciclo Superior (4º y 5º) del plan antiguo. El próximo curso 2008-09, se implantará el Nivel Avanzado.

• Oficial: presencial, los alumnos acuden a clase y pueden examinarse por cursos en las convocatorias correspondientes.
• Libre: el alumnado no asiste a clase y únicamente se presenta a las pruebas de certificación de los diferentes niveles. No existe límite de convocatorias. No se puede simultanear una matrícula oficial y una libre para el mismo idioma, en un mismo curso académico.

La superación de las pruebas establecidas al final de cada ciclo da lugar a la obtención de la correspondiente certificación académica:

• Certificado de Nivel Básico (A2)
• Certificado de Nivel Intermedio (B1)
• Certificado de Ciclo Superio o Aptitud. El próximo curso 2008-09, este certificado será sustituido por el Certificado de Nivel Avanzado (B2).

Estas tres titulaciones son oficiales tanto en la Comunidad Autónoma Vasca como en el resto del estado español.

- El Certificado de Ciclo Superior o Aptitud está convalidado con el EGA (Decreto 263/1998 de 6 de octubre, BOPV de 23 de octubre).
- El Gobierno Vasco contempla así mismo las siguientes equiparaciones para los trabajadores públicos:

• El 4º curso de EOI equivale al PL1 de Educación y al PL2 de la Administración Pública Vasca.
• El Certificado de Ciclo Superior o Aptitud equivale al PL2 de Educación y al PL3 de la Administración Pública Vasca.